小朗課堂 前兩天,小朗在與某實(shí)驗(yàn)室研究員交流時了解到這么一個情況,他們在qPCR實(shí)驗(yàn)時使用透明管,得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果熒光信號值比較低,曲線被壓得很低,坐標(biāo)軸也不太能自適應(yīng)曲線,顯示如下圖。 而正常情況如下圖,縱坐標(biāo)的范圍是可以隨著曲線最大熒光信號值而變化的,并可獲得一條漂亮的S曲線。 明白了這個情況后,小朗為其推薦了白管,更換成白管后,問題就迎刃而解了。 那么,問題來了, 為何做qPCR實(shí)驗(yàn)時一定要用白管呢? 熒光信號值與哪些因素有關(guān)呢? 我們一起來學(xué)習(xí)一下吧~ PCR管/板常見的有白色和透明兩種。在傳統(tǒng)PCR實(shí)驗(yàn)中,兩者在使用效果上沒有太大差異,相比較透明管更為方便,因?yàn)閷?shí)驗(yàn)者更容易看清楚試劑加上與否。但在熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)中,白管的優(yōu)勢就凸顯出來了。 qPCR實(shí)驗(yàn)的核心數(shù)據(jù)是Ct值,而熒光信號是Ct值計(jì)算的數(shù)據(jù)來源,所以管內(nèi)的熒光能否完好地傳遞至頂部的檢測器是至關(guān)重要的。 如下圖是三種不同透明度的管子,因?yàn)橥该鞴芩闹芫峭该鞯模瑢τ诘撞吭噭┘ぐl(fā)出來的熒光會散向四面八方,管內(nèi)的熒光信號只有少量能到達(dá)管頂部,最終只有少量信號進(jìn)入檢測器,且管間熒光信號不一致。 圖1 白管和透明管內(nèi)部熒光信號路線圖 然而,如圖1所示,與其他管材相比,白管管壁不透明,幾乎沒有信號丟失,且隔絕了樣品臺污染的熒光信號干擾,減少了相同樣本孔間差異。 圖2 白管和透明管檢測信號對比圖 從圖2中可以看出,同樣試劑量的情況下,到達(dá)檢測器的信號強(qiáng)度,使用白管明顯高于透明管。因此相比于透明管,使用白管可明顯提高檢測器檢測到的信號強(qiáng)度,提高qPCR數(shù)據(jù)的靈敏度。 正因?yàn)榘坠苡兄哽`敏度的特性,使用白管可以采用小體積反應(yīng),從而可減少實(shí)驗(yàn)試劑量,大大節(jié)省成本~ 圖3 白管擴(kuò)增結(jié)果展示圖 國際一線品牌也同樣證實(shí)白管更適合實(shí)時熒光定量實(shí)驗(yàn)的結(jié)論。 賽默飛 如上圖,qPCR使用透明和白色耗材的結(jié)果比較: (A)與透明孔相比,白色孔Ct值更低(靈敏度更高)。 (B)白色孔在技術(shù)重復(fù)中也表現(xiàn)出更高的一致性。 在設(shè)置實(shí)時PCR或qPCR的反應(yīng)時,與透明耗材相比,我們更推薦使用白色耗材,以實(shí)現(xiàn)靈敏和準(zhǔn)確的熒光檢測。 ——賽默飛生命科學(xué) Jena Sarstedt Eppendorf 那么熒光定量PCR儀需要采用 什么技術(shù)才能滿足使用白管呢? 我們來看一下 國際主流品牌的定量PCR儀產(chǎn)品, 一探究竟吧~ 首先我們來看一下賽默飛的高端系列Q5和Q7,他們用的是CCD頂部檢測的技術(shù)方案,再來看一下羅氏的旗艦產(chǎn)品LG480,我們可以看到,他們用的也是CCD頂部檢測技術(shù)。 朗基是國內(nèi)第一家全部采用頂部CCD檢測技術(shù)的定量PCR儀廠家。 朗基奧金系列熒光定量PCR系統(tǒng) 頂部CCD檢測技術(shù)光學(xué)部件固定,穩(wěn)定性好,故障率低,對熒光信號的接收和處理能力強(qiáng),是定量PCR儀檢測技術(shù)的大勢所趨。 頂部CCD檢測技術(shù) 此外,同樣是白管,我們實(shí)驗(yàn)證明白管的質(zhì)量高低也會影響熒光信號值的大小。如下圖: 結(jié)果表明,相較于其他品牌白色管和透明管的擴(kuò)增曲線,朗基標(biāo)配的白色管的熒光信號值更強(qiáng),曲線重合度更好。 綜上所述, 在進(jìn)行qPCR實(shí)驗(yàn)時, 使用白管和頂部檢測技術(shù)的qPCR儀, 可獲得更佳實(shí)驗(yàn)結(jié)果。 朗基奧金系列熒光定量PCR儀 采用頂部CCD檢測技術(shù), 配套的管材都是白管, 也可單獨(dú)采購白管, 歡迎選購朗基產(chǎn)品, 聯(lián)系我們哦~